Institut for Statskundskab er opdelt i en række afdelinger. Afdelingerne udgør den overordnede struktur for instituttets samlede virksomhed, der koordinerer undervisning, personaleforhold og overordnede forskningsstrategier.
Afdelingsformand: Rasmus Brun Pedersen
Sektionsformand: Anne Mette Kjeldsen
Sektionsformand: Vibeke Lehmann Nielsen
Sektionsformand: Gert Tinggaard Svendsen
Sektionsformand: Rune Slothuus
Afdelingsformand: Tore Vincent Olsen
Afdelingsformand: Thomas Olesen
Formand: Helene Helboe Pedersen
Afdelingsleder: Rasmus Brun Pedersen
Centerleder: Carter Bloch